讲座:“New approaches to protein structure prediction ”
主 讲 人: Dr Yang Zhang
Center for Bioinformatics and Department of Molecular Biosciences,
University of Kansas
时 间: 10月10日 3:30—5:00pm(周二下午)
地 点:高等研究中心地下报告厅
主办单位:清华大学周培源应用数学研究中心
讲座摘要:
We developed a new algorithm of TASSER (Threading/ASSembly/Refinement) for protein structure predictions. The method is a composite approach of threading, ab initio modeling, and structural refinement. We will discuss the results of large-scale TASSER benchmarking, and the application of TASSER methodology on genome-scale protein structure generations for all ORFs in E. coli genome and all G-protein coupled receptors (GPCR) in human genome. We will also introduce the recent progress on the I-TASSER development and the newest blind test results of CASP7 competition in 2006.
Dr Yang Zhang研究领域最新进展
蛋白质结构预测关键技术分析大赛(Critical Assessment of Structure Prediction,CASP) 是一个大规模的蛋白质结构预测技术评比活动,代表着蛋白质结构预测领域的世界前沿水平,号称是蛋白质建模方面的奥林匹克,吸引了世界范围内的很多研究小组竞相参与。在2006年9月CASP7公布预测评比结果:Dr Yang Zhang 领导的小组借助于他们提出的TASSER方法,在最重要和最有声望的服务器自动预测项目中取得最优异的预测结果,并且遥遥领先于其它小组。这种计算机预测方法已经在分子生物学研究上得到了实际应用。 |