简介: |
In this talk, I will present a few topics on computational systems biology, i.e., how to quantify disease states, predict disease transitions, and further infer causal relations in biological systems based on big-data with generic principles of nonlinear systems. 1.We develop a model-free method to detect early-warning signals of critical transitions in complex diseases. Specifically, we theoretically derive an index based on a dynamical network biomarker (DNB) that serves as a general early-warning signal indicating an imminent bifurcation or sudden deterioration before the critical transition occurs. 2.We propose a method to predict systems’ low-dimensional dynamics from high-dimensional but short-term data. Intuitively, it can be considered as a transformation from the inter-variable information of the observed high-dimensional data into the corresponding low-dimensional but long-term data, thereby equivalent to prediction of time series data.
报告人简历:陈洛南1984年获华中科技大学电气工程学士学位;1988年获日本东北大学系统科学硕士学位;1991年获日本东北大学系统科学博士学位。1997年起任日本大阪产业大学副教授;2000年起任美国加州大学洛杉矶分校(UCLA)访问教授;2002年起任日本大阪产业大学教授;2007年筹建上海大学系统生物技术研究所并首任所长(兼);2009年4月起任日本东京大学(兼)研究教授;2009年10月至今任中科院系统生物学重点实验室执行主任,研究员,博士生导师,研究组组长。2009年获中科院-诺和诺德长城教授奖。目前,在计算系统生物学领域的主要国际学术期刊中担任重要工作,Springer《系统生物学百科全书》编辑,IEEE-SMC《系统生物学委员会》主席,中国运筹学会《计算系统生物学分会》理事长。主要从事生物信息学、网络生物学及计算系统生物学等领域的研究工作。 |